Balinaların evrimi, 50 milyon yıl önce karada yaşayan memelilerin suya geçişiyle başlamıştır. Fosiller, bu canlıların suya adaptasyon sürecini ve evrimsel değişimlerini göstermektedir. Pakizeus, ambulans ve dorudon gibi atalar, zamanla modern balinalara dönüşmüştür. Balinalar, hala atalarından kalan körelmiş organlara sahiptir.